Né en 1972 à Montreuil, fils du bassiste Bernard Paganotti, Antoine commence le piano à 9 ans au Conservatoire de Montreuil pour ensuite choisir la batterie de son propre gré dès l’âge de 14 ans.
Il commence le métier de musicien à 19 ans en 1991, d’abord avec le compositeur-claviériste Patrick Gauthier, puis dès 1999 rejoint le groupe français Magma en tant que chanteur jusqu’en 2008, avec lequel il participe aux albums Theusz Hamtaahk Trilogie (2001), K.A. (2004) et Ëmëhntëhtt-Rê (2009), aux DVDs Mythes et Légendes : Epok II, Epok III et Epok IV parus entre 2006 et 2008 et à des dizaines de concerts, en Europe, aux États-Unis et au Japon.
Quittant Magma en 2008 pour se concentrer sur la batterie, il est sollicité par d’innombrables solistes de premier plan de la scène jazz historique ou contemporaine, tels Benny Golson, Kenny Wheeler, Denise King, Abraham Burton, Jérémy Pelt, Perico Sambeat, David Doruvska, Chris Cheek, Olivier Hutman, Gaël Horellou, Pierrick Pédron, Richard Pinhas, Jérôme Barde, Baptiste Trotignon, Pierre de Bethmann, Vincent Peirani, Yoann Loustalot, Pierre Perchaud, Christophe Panzani, David Prez, Sandro Zerafa, Thomas Curbillon, Nicolas Moreaux, Arnaud Cuisinier…
Antoine Paganotti a tourné au Japon, au Canada, aux Etats-Unis, au Mexique, en Russie, et dans toute l’Europe.